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enLbCas12a Nuclease

貨號(hào) 32135 售價(jià)(元) 詢價(jià)
規(guī)格 100pmoL/1000pmoL CAS號(hào)
  • 產(chǎn)品簡(jiǎn)介
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產(chǎn)品簡(jiǎn)介

enLbCas12a(enhanced LbCas12a)是一種基于野生型LbCas12a核酸內(nèi)切酶升級(jí)改造獲得的高活力LbCas12a突變體。與野生型LbCas12a的作用機(jī)制一樣,enLbCas12a也通過crRNA介導(dǎo),靶向識(shí)別帶有PAM序列(5’-TTN-3’)的雙鏈DNA,使DNA雙鏈斷裂并產(chǎn)生粘性末端。同時(shí),enLbCas12a對(duì)單鏈DNA靶標(biāo)的識(shí)別和剪切不依賴PAM序列。雙鏈或單鏈DNA靶標(biāo)均能激活enLbCas12a的反式剪切活性(即旁路剪切活性/附屬剪切活性),即當(dāng)enLbCas12a酶與crRNA、靶標(biāo)DNA結(jié)合形成三元復(fù)合物后,便會(huì)被激活針對(duì)非特異ssDNA序列的反式剪切活性,將體系中的ssDNA序列切碎。因此,enLbCas12a酶不僅可用于體外dsDNA的特異剪切,也可用于靶標(biāo)核酸的快速檢測(cè)。

 

產(chǎn)品組分

組分 32135-01 (100 pmol) 32135-03 (1,000 pmol)
enLbCas12a Nuclease (10 μM) a 100 pmol 1,000 pmol
10×HOLMES Buffer for Cas12a 1 mL 1 mL

a. enLbCas12a Nuclease濃度為10 μM,即10 pmol/μL;100 pmol規(guī)格的總體積為10 μL,1,000 pmol規(guī)格的總體積為100 μL;

 

保存條件

-80℃或-20℃儲(chǔ)存;干冰運(yùn)輸。

 

活性定義

在總體積為20 μL的1 × HOLMES Buffer for Cas12a [pH 8.5]反應(yīng)體系中,37℃反應(yīng)條件下,1 min內(nèi)剪切1 pmol ssDNA探針?biāo)璧腃as12a酶量定義為1 transU。

例:若某批次enLbCas12a酶的反式切割活性為80.0 transU/pmol,則表明1 pmol的該批次enLbCas12a酶可在1 min內(nèi),在上述指定的反應(yīng)條件下,反式切割80 pmol ssDNA探針。

 

實(shí)驗(yàn)流程

1. 順式剪切實(shí)驗(yàn)

組分 體積 終濃度
10×HOLMES Buffer for Cas12a 2 μL 1 ×
10 μM enLbCas12a Nuclease 0.5 μL 250 nM
10 μM crRNA 0.5 μL 250 nM
1 μM Target DNA b 0.5 μL 25 nM
Nuclease-free Water Up to 20 μL  

b. 順式剪切體系中Target DNA可為ssDNA或帶PAM序列的dsDNA。

若用核酸電泳來分析順式剪切產(chǎn)物,建議使用dsDNA靶標(biāo),因?yàn)閟sDNA靶標(biāo)會(huì)被反式激活的Cas12a進(jìn)一步切碎。對(duì)于20 μL順式剪切應(yīng)體系,推薦target DNA的使用量為100 ng~500 ng,且target DNA片段長(zhǎng)度在300 bp~3 kb范圍內(nèi)。不同長(zhǎng)度target DNA需要的Cas酶和crRNA的量需要根據(jù)target DNA的摩爾量計(jì)算,建議保持Cas酶:crRNA:target DNA的摩爾比為10:10:1,以盡量確保target DNA被剪切完全。

37℃反應(yīng)30 min ~ 1 h,85℃滅活5 min,核酸電泳分析順式剪切產(chǎn)物。

 

2. 反式剪切實(shí)驗(yàn)

組分 體積 終濃度
10×HOLMES Buffer for Cas12a 2 μL 1 ×
10 μM enLbCas12a Nuclease  0.05~0.5 μL 25~250 nM
10 μM crRNA 0.05~0.5 μL 25~250 nM
1 μM Target DNA c 0.5~5 μL 25~250 nM
10 μM ssDNA Reporter 0.05~0.5 μL 25~250 nM
Nuclease-free Water Up to 20 μL  

c. 反式剪切體系中Target DNA可為ssDNA或帶PAM序列的dsDNA。

反式剪切體系中各組分的用量可以根據(jù)不同的實(shí)驗(yàn)?zāi)康倪M(jìn)行調(diào)整,用量較少時(shí)可先將各組分稀釋后加入體系,enLbCas12a Nuclease可用1×HOLMES Buffer for Cas12a稀釋,稀釋后需立即使用(若要稀釋后的Cas12酶長(zhǎng)期保存,請(qǐng)使用Cas12 Dilution Buffer,#32012),crRNA、Target DNA及ssDNA Reporter可用Nuclease-free Water稀釋,但極低濃度的Target DNA(例如LOD實(shí)驗(yàn))建議用0.1% Tween 20稀釋并使用低吸附的離心管、吸頭等耗材。

實(shí)時(shí)熒光定量PCR儀檢測(cè)熒光信號(hào),37℃反應(yīng),每30 sec采集一次熒光信號(hào)。

 

實(shí)驗(yàn)結(jié)果

順式剪切

反式剪切

 

注意事項(xiàng)


1. 高活力的enLbCas12a酶crRNA的DR序列(Direct Repeat)與野生型LbCas12a(#32108)一致,可以在反應(yīng)體系中用enLbCas12a酶直接替換野生型LbCas12a。
2. 不同來源的Cas12a酶,其識(shí)別靶標(biāo)所需的PAM位點(diǎn)也略有不同,其中大部分Cas12a酶可識(shí)別TTN或TTTN位點(diǎn)。
3. Cas12a的順式剪切(cis-cleavage):Cas12a在crRNA的引導(dǎo)下,特異性地剪切target DNA。dsDNA靶標(biāo)需帶有PAM位點(diǎn),而ssDNA靶標(biāo)不依賴PAM位點(diǎn)。
4. Cas12a的反式剪切(trans-cleavage):當(dāng)target DNA存在時(shí),Cas12a/crRNA與target DNA形成三元復(fù)合物(Cas12a/crRNA/target DNA),同時(shí),Cas12a被激發(fā)反式剪切活性,將反應(yīng)體系中任意序列的單鏈DNA切碎。
5. 利用本產(chǎn)品的反式剪切活性進(jìn)行分子診斷實(shí)驗(yàn),可參考本公司的HOLMES體系[1]。
6. 為防止RNase污染,請(qǐng)保持實(shí)驗(yàn)區(qū)干凈整潔,操作時(shí)需穿戴干凈的手套、口罩,實(shí)驗(yàn)所用槍頭、離心管等耗材均為RNase-free。
7. Cas12a酶對(duì)熱敏感,容易失活,應(yīng)全程冰上配置反應(yīng)體系,并在使用后立即將酶置于-20℃保存。
8. 本產(chǎn)品僅供科研使用。